宿舍扣除员工工资一般不合法，除非劳动合同有约定。依据《劳动法》，工资总额包含多项，不应随意扣除，否则可能影响员工权益，造成劳动纠纷。
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宿舍扣工资不合法。处理：1.查看劳动合同，确认是否有相关约定；2.无约定时，与雇主沟通，要求合理解释；3.沟通无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；4.保留证据，如工资条、合同等，以备不时之需。
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处理宿舍扣工资问题，可先查看劳动合同，有约定则按约定处理，无约定则可与雇主协商或申请劳动仲裁。选择方式需根据具体情况，协商无果时考虑法律途径。