合作医疗停了两年，现在交费后一般在第二年1月1日生效。**分析说明**：从法律角度看，农村合作医疗的缴费与生效时间遵循当地医保政策。断交后虽然可以续交，但需要重新等待一段时间后才能享受医保待遇。大部分地区规定，只要在每年的9月至12月期间完成缴费，即可从第二年的1月1日开始享受医保待遇。因此，即使停了两年，现在交费也遵循这一规定。**提醒**：若交费后长时间未收到医保生效通知，或在此期间发生医疗费用无法报销，表明问题可能比较严重，应及时寻求专业人士的进一步解决。###
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处理方式**：从法律角度讲，农村合作医疗断交后的处理方式主要有两种：一是补缴费用并等待生效；二是咨询当地医保部门了解具体政策。**选择建议**：*如果希望尽快恢复医保待遇，应尽快完成缴费手续，并咨询当地医保部门了解具体的生效时间。*如果对当地政策有疑问或不确定如何操作，可以直接向当地医保部门咨询或寻求专业人士的帮助。###
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具体操作**：从法律的角度，农村合作医疗断交两年后在不同情况下的处理方式如下：1.**了解当地政策**：首先，应咨询当地医保部门或查阅相关政策文件，了解具体的补缴和生效规定。2.**补缴费用**：根据当地政策规定，补缴所欠的合作医疗费用。部分地区可能不要求补缴以前年度的费用。3.**等待生效**：*如果当地政策规定缴费后在次年1月1日生效，那么需要等待到该日期后才能享受医保待遇。*如果当地政策设置了等待期（如30-90天或不超过6个月），则需要等待该期限结束后才能享受医保待遇。4.**特殊情况处理**：在等待期间如果发生医疗费用，应及时咨询当地医保部门，了解是否可以通过其他途径获得医疗救助或报销。如果遇到政策变动或特殊情况导致无法及时享受医保待遇，可以向当地医保部门申诉或寻求法律援助。